W Pracowni Anatomii Patomorfologicznej (Prosektorium) wykonywane są autopsje sądowo-lekarskie i administracyjne oraz przyjmowany jest materiał do badań histopatologicznych, cytologicznych, immunohistochemicznych, immunofluorescencyjnych, mikroskopowo-elektronowych, biopsji aspiracyjnej cienkoigłowej oraz autopsyjnych, wykonywanych przez NZOZ Zakład Patomorfologii ALFAMED w Zamościu.